Bal kabağının saklama süresi bütün veya kesilmiş olmasına göre değişir; bütün kabaklar serin ve kuru yerde uzun süre dayanırken, kesilen parçalar nem ve hava temasından korunarak buzdolabında muhafaza edilmeli veya daha uzun süreli saklama için porsiyonlanıp dondurucuda dondurulmalıdır.
Kesilmemiş bal kabağının serin, kuru ve doğrudan güneş almayan bir ortamda hava sirkülasyonu sağlanarak muhafaza edilmesi; aşırı nemden uzak tutulması ve kabuk bütünlüğünü bozacak darbelere karşı korunması uzun süreli saklama için temel koşuldur.
Kesilen bal kabağının oda sıcaklığında bırakılmayıp, kesik yüzeyi kapatılarak temiz bir saklama kabında ve kuru şekilde buzdolabında muhafaza edilmesi hava temasını azaltarak bozulmayı geciktirir.
Bal kabağını kabuk ve çekirdeklerinden arındırıp porsiyonluk parçalara ayırdıktan sonra, dilerseniz çiğ olarak ya da hafifçe haşlayıp pişirerek hava almayan dondurucu poşetlerinde saklayabilir; bu sayede ihtiyaç duyduğunuzda kolayca kullanabilirsiniz.
Bal kabağında kötü koku, küf, aşırı yumuşama veya yapışkan doku gibi bozulma belirtilerinin düzenli olarak kontrol edilmesi, şüpheli kısımların ayrılması ve eziklerin yakından takip edilmesi diğer sağlam kısımların güvenle saklanmasını sağlar.